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circRNA荧光定量

环状RNA(circRNA)是区别线性RNA的一类新型RNA,结构为环状,大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感,比线性RNA更为稳定,使其在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势近来已成为新的热点。

本着跟踪前沿、不断创新的原则,阅微基因从2015年开始提供环状RNA的表达检测服务,更好的服务于科研客户

服务项目

环状RNA的实时定量表达检测
环状RNA有其独特的特点,其闭环结构导致引物设计的规则与传统大有不同,同时在表达检测的条件上也需要多次摸索。基于此基础上,我们能够提供有效和准确的表达检测。

技术路线

circRNA信息表达检测服务






技术特点:

circRNA的环状结构经过不同的可变剪切形成。设计逆转录引物时,根据其反向剪切位点的周围序列进行设计。该引物只能逆转录出环状RNA,而不能逆转录出包含反向剪切位点序列的线性RNA。成功逆转录后,可根据序列特点设计相应的通用引物和特异性TaqMan探针对其进行荧光定量。

环状RNA逆转录引物设计示意图


收样要求

组织
>300mg 新鲜动植物样本,≥100mg叶片样本等
细胞
>106个悬浮/贴壁细胞
血液
>1ml全血/全血分离的有核细胞
血清
>1.5ml

RNA

总RNA >4μg,体积>20μl,浓度> 200 ng/μl

您可以得到的数据分析

引物(或探针)及序列,原始数据、扩增曲线、溶解曲线(SYBR Green方法)、数据分析结果报告。


目的circRNA和的扩增曲线(仪器为Roche 480)


目的circRNA的溶解曲线(仪器为Roche 480)

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