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文章速递 | MicroreaderTM 23HS plex ID System试剂的人群多态性调查

【2024-07-23】


摘要  ABSTRACT


评价MicroreaderTM 23HS Plex ID System试剂盒中包含的23个常染色体STR基因座在中国北方汉族人群中等位基因频率分布,获得群体遗传数据,探究其在法医学中的应用价值。结果显示,23个基因座在北方汉族人群中具有较高的个体识别能力,应用价值较高,适用于全同胞以及半同胞关系鉴定。


引言  INTRODUCTION

2023年新版的《生物学半同胞关系鉴定技术规范 》(SF/T 0131-2023)要求3种鉴定情形所采用检测系统的系统效能均应大于0.75 ,即只2个体配对的半同胞关系鉴定 ,检测的常染色STR基因座数量应当在73个以上;三个体和四个体组合半同胞关系鉴定,因鉴定参考人员数量增加获取的遗传信息更多,需要检测的基因座数量也相应的减少,分别不少于39个和35个。2个标准还同时要求除19个必检基因座外,增加检测的基因座不存在连锁不平衡且平均个体识别能力不低于0.900。因此在遇到复杂亲缘鉴定时,如果没有条件增加参考人员,则应尽可能多的增加检测系统以提高系统效能,降低错判的风险。


MicroreaderTM 23HS Plex ID System 试剂盒作为常染色体补充试剂盒,检测的基因座包括:D4S2408,D9S2157,D12S391,D20S161,D3S2459,D18S1364,D13S305,D1S2142,D22S1045,D19S400,D6S1017,

D7S1517,D2S1776,D2S1360,D3S1744,D16S3391,D3S1545,D11S4463,D20S85,D1S549,D2S441,D10S2325,

D21S2055及Amelogenin性别基因,这些STR基因座在文献报道中个体识别力DP均不小于0.9。然而对这些STR基因座研究结果受限于样本数量和采样范围,其在中国北方汉族人群中的多态性研究仍不充分。


方法  METHOD

调查对象来源于北方汉族人群中无关DNA样本548例,调查23个基因座的遗传多态性和法医学参数;按照 MicroreaderTM 23HS Plex ID System试剂盒说明书进行PCR复合扩增;扩增产物通过ABI 3500XL遗传分析仪进行电泳检测,检测结果使用 GeneMapper ID-X v1.5软件进行分析。


结果  RESULT

1.中国北方汉族人群等位基因频率 

548例无关样本的23个常染色体基因座共检出260个等位基因,单个基因座等位基因分型数量介于6个(D4S2408)~23个(D10S2325),等位:基因的频率分布在0.000 9~0.590 2之间见表1:


2.中国北方汉族人群中群体遗传学参数 

23个常染色体STR基因座的杂合度H为0.611(D2S1360)~0.885(D21S2055),多态信息指数PIC为0.577(D2S1360)~0.864(D21S2055),个体识别DP为0.815(D2S1360)~0.973(D21S2055),平均DP为0.922,非父排除率PE为0.577(D2S1360)~0.864(D21S2055),CDP=1-3.663×10-27,CPE=1-2.668×10-16。χ2检验表明所有基因座均未显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P > 0.05),见表2。


结论  CONCLUSION


结果表明MicroreaderTM 23HS plex ID System试剂中的23个基因座均符合哈迪-温伯格平衡(P > 0.05),与规范中要求的19个必检基因座不存在连锁不平衡,且平均个体识别力为0.922(大于0.9)。联合MicroreaderTM 21 ID System和MicroreaderTM 23sp ID System (阅微基因)可使检测基因座数目达到60个,能够满足规范中对全同胞与多个体半同胞的检测需求。 


本文统计分析的数据结果,是对目前常染色体STR检测系统的有效补充,大大增加了可用的常染色体STR基因座数量,显著提高了检测体系的效能,提供了一些北方汉族人群常染色体遗传学数据,对丰富法医学STR分型数据库也具有一定的实际意义,为 MicroreaderTM 23HS Plex ID System 应用于全同胞关系鉴定和半同胞关系鉴定提供了可靠的数据支持。


参考文献: 

石妍,江坚,陈冲,张京晶,贾莉,高知枭,李惠芬,严江伟,任贺. MicroreaderTM 23HS Plex ID System中23个常染色体STR基因座在中国北方汉族人群中多态性调查[J].昆明医科大学学报,2024,45(7):154-159.doi: 10.12259/j.issn.2095-610X.S20240723



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