核糖体 DNA 是微生物（细菌及真核微生物 ) 中最具广泛多态性的序列。在菌种（属）的鉴别上具有非常高效的区分能力。通过一代测序可对单菌进行种属鉴别，通过二代高通量测序则可对环境样本中的整体微生物情况，包含种属组成及丰度进行评估，在农牧中已应用于土壤、水文环境调查、堆肥处理、厌氧消化、动物营养等领域。
项目
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项目 |
检测基因 |
接收样本类型 |
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微生物多样性分析 |
16S/18S* |
土壤、水体、淤泥、乳品、肠道内容物等 |
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微生物多样性分析 |
ITS II 区 |
土壤、水体、淤泥、乳品、肠道内容物等 |
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微生物宏基因组分析 |
整个基因组 |
土壤、水体、淤泥、乳品、肠道内容物等 |
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环境样本菌种鉴定 |
16S |
土壤、水体、淤泥、乳品、发酵液等 |
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单菌菌种鉴定 |
16S/18S/ITS |
培养单菌或菌液 |
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单菌菌种鉴定 |
基因组重测序 |
培养单菌或菌液 |
* 常规检测 V3 或 V4 区，可提供 V3-V4 及其他区域
案例
技术优势
■ 对各种环境或杂难样本有丰富的核酸提取经验，处理过粪便、土壤、水体、空气、动植物体表或体内等类型样本
■ 分析内容多样化，支持不同领域的应用或数据要求
流程
■ 环境样本：需求确认 >> 采样方案 >> 送检 >>DNA 提取 >>PCR 扩增建库 >>NGS 测序 >> 分析及报告
■ 单菌样本：需求确认 >> 方案 >> 送检 >> 扩增 >> 产物纯化或克隆 >> 一代或二代测序 >> 菌种序列比库
