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单细胞测序

单细胞测序

随着测序技术不断发展以及测序成本的降低,使得基因组测序已经成为常规技术。通过提取组织或细胞群体的核酸进行基因组或转录组的研究,忽略了细胞间的差异对调控基因表达、细胞行为和药物反应的作用,已经不能满足研究人员的要求。因此单细胞测序(包括基因组和转录组测序)技术应运而出,它使科研人员可以针对单个细胞进行深入的研究,为组学研究开辟了新的篇章。
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。可以不需培养细胞,获得单克隆癌细胞的具体突变来源及精准的突变频率,以及区分癌症发生、发展、演化过程中的突变等。
单细胞转录组分析主要用于在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。与活细胞成像系统相结合,单细胞转录组分析更有助于深入理解细胞分化、细胞重编程及转分化等过程及相关的基因调节网络。

技术路线

生物信息分析

案例解析

通过染色体序列覆盖度分析比较三种单细胞全基因组扩增方法(GenomePlex WGA4,MDA和MALBAC)的扩增重复性及全基因组层面的扩增均一性。

(Ning L, Li Z, Wang G,)

测序策略及数据量

测序策略:PE125、PE150
建议数据量:请参照相对应的普通测序数据量

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