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阅微基因2020Q1客户发表文章速递(附亮点文章解读)

【2020-04-30】

       纵使艰难,但科研的脚步从未停歇。

       阅微基因一季度新增客户发表16篇(包含1篇BioRxiv预印刊),其中IF 5分以上文章5篇(31%),总影响因子60分,平均影响因子4.00分;近5年(2016-2020Q1)累计发表220篇,总影响因子超900分,平均影响因子达4.27分。
       以阅微基因的三大服务领域区分,科研文章最多(13篇),覆盖细胞鉴定与个体识别、全外显子测序、转录组测序、肿瘤甲基化研究、植物遗传多样性和育种、昆虫线粒体测序等项目;法医领域2篇,包含试剂盒开发和验证;临床领域1篇,为MSI分子标记在中国东部结直肠癌患者的大样本数据报导。

阅微基因2020年一季度客户应用发表文章一览



 亮点速递 

 本季最高 

期刊:THERANOSTICS,IF=8.063
作者:华中科技大学武汉光电国家研究中心生物医学光子学功能实验室张智红团队
 
       在黑色素瘤小鼠模型中,利用激光免疫治疗(Laser immunotherapy, LIT)结合新颖局部免疫刺激剂(N-dihydrogalactochitosan, GC)刺激肿瘤免疫后,用活体成像和免疫学分析观察关键免疫细胞——中性粒细胞的激活情况:中性粒细胞迅速在激光治疗后4小时起浸润吞噬肿瘤细胞,同时12小时后细胞因子的释放达到高峰;并且激光的光热效应能使肿瘤消融并诱发损伤相关的分子机制,引发其他细胞的肿瘤毒杀。在LIT处理的荷瘤小鼠中也观察到其抵抗了肿瘤的肺部转移以及肿瘤浸润淋巴细胞的增加,与免疫阻断点的免疫治疗具有协同作用。本研究揭示了LIT诱导的中性粒细胞原位浸润的肿瘤清除机制,研究中使用的B16小鼠黑色素瘤细胞在阅微基因进行了细胞STR鉴定。


 临床我独秀 

期刊:FRONT GENET,IF=3.517
作者:青岛大学附属医院病理科邢晓明团队

       作者从2017年1月-2019年4月连续收集了2,356名结直肠癌(CRC)患者的数据,记录其临床病理指标和分子标记(KRAS、NRAS、BRAF和MSI),其中MSI-H的患者比例为6.31%,是KRAS(40.15%)以外比例最高的突变指标。根据大群体结果分析发现,中国东部CRC患者的数据与西方及国内其他地区具有差异:MSI-H更常见于年轻患者中肠壁浸润较深且分化差的多发性肿瘤,而MSS患者倾向于发展淋巴结转移和黏液性神经周围浸润性肿瘤。本研究为我国结直肠癌患者常见分子标记结合病理发展提供了支持性证据,研究中使用阅微基因肿瘤微卫星不稳定性试剂盒。



天生小心肠

期刊:J ADV RES,IF=5.045
作者:北医三院消化内科段丽萍团队

       肠易激综合征(IBS)是非常常见的胃肠道疾病,全球流行率12%,中国数据为6.5%且每年上升,且常共病抑郁症(DD),已知这两种疾病有相似的生理病理过程,但遗传风险的证据有限。段丽萍团队通过对 IBS、DD和健康人各35例样本进行了全外显子测序(混池建库)及变异筛选,后使用SNaPShot技术在各约140名的队列人群中对SNV进行验证,发现了3个易感位点,其中2个同时与IBS和DD显著相关,其基因在神经发生和神经传递中起着重要作用。此篇研究初步报道了肠易激综合征的中国人群易感位点,从易感基因角度切入肠易激综合征研究,结合段丽萍主任先前的研究成果,相信未来很快能看到宿主基因型如何影响其肠道菌分布的新成果。 本研究的外显子测序由阅微基因提供技术服务与支持。


 走出西非 
产品:19X ID
期刊:INT J LEGAL MED,IF=2.094
作者:中南大学基础医学院法医系,中非传染病研究中心Lagabaiyila Zha团队

       19X ID 是阅微基因专为X染色体遗传跟踪所开发的试剂盒,与常染色体及Y染色体试剂盒联用可对特殊亲缘关系鉴定等复杂案例或案件起到有效补充。中南大学基础医学院法医系,中非传染病研究中心Lagabaiyila Zha团队,通过检测550名西非塞拉利昂共和国人对试剂盒所选择的位点进行了评估,结论认为19X ID 在西非这个面积7.17万平方公里,700万人口,具有16个民族的国家同样表现出色,位点符合哈温平衡且具有高度多态性,可在复杂的法医案件、亲缘关系分析以及个体识别中提供有效信息。阅微基因的法医DNA扩增试剂盒除了已验证适用于中国各民族(北方及南方汉族、蒙古族、维族、藏族、回族、哈萨克族等)外,第一次走向非洲大陆。



新冠新受体
产品:细胞鉴定
期刊:BioRxiv 预印,IF=NA
作者:空军军医大学细胞工程研究中心、细胞生物学国家重点学科陈志南院士团队

       作者研究发现,除了ACE2之外,病毒还能通过一个名为CD147-SP的外膜S蛋白结合细胞上的CD147跨膜糖蛋白而入侵细胞。在体外实验中,人源化CD147抗体—Meplazumab可有效抑制病毒对于细胞的感染。并通过表面等离子共振、Co-IP、ELISA等分析方法证明了两者之间的相互作用。新冠病毒新型细胞结合受体的发现,可望为COVID-19治疗中特定抗病毒药物的开发提供新的治疗靶标。本篇文章所使用的猴源及人源细胞的STR鉴定由阅微基因提供。


 老龄不是问题 

产品: 21 ID
期刊:STEM CELL RES,IF=3.929
作者:河北医科大学—爱尔兰高威大学干细胞研究中心马隽教授团队

       作者利用仙台病毒HVJ重编程技术,成功从一位78岁老龄女性身上的皮肤成纤维干细胞建立出多能干细胞系(iPSC)。该细胞系可应用于老化研究,或经再诱导分化后作为神经退行性疾病研究时的参照细胞,未来并可望转化为该类疾病干细胞治疗手段。本研究中使用阅微基因21ID 常染色体STR分型试剂盒验证得出的干细胞和供者细胞为同一来源。



本季我最甜

产品:SSR检测
期刊:SUGAR TECH,IF=1.024
作者:福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室阙友雄团队

       中国公益性产业研究项目,农业部948项目支持的甘蔗种质资源及近缘属种的SSR标记研究,由阙友雄团队持续推进。在本发表中以15对SSR引物对从3轮全国甘蔗区域试验以及4轮集成示范中取得的68个品种进行检测,数据显示,该15对引物的多态信息量高达0.933,将68个品种分为5大群,第V群也是国内最广泛栽植的一群基因异质性低,其中的一支包含国内甘蔗主要亲本ROC22及与其在基因上非常相近的另三个品种,他们可能具有同样优良的表型及推广潜力。本研究中,SSR分型的工作由阅微基因承担。




       以上是本季度节选出来具有代表性的客户应用文章。可以发现,阅微基因的服务范围覆盖非常广泛的领域,并且在各领域研究中都有极强的应用价值及转化潜力。如果您也想和这样的阅微基因合作,请与我们联系~

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