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【2019-09-05】
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实验使用进口试剂盒
阅微基因16S/18S扩增子测序使用进口 QIAGEN 核酸提取试剂盒与进口KAPA建库试剂盒,确保服务质量。
QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit
(此试剂盒用作粪便样本的DNA提取,其他样本类型另采用不同款试剂盒)
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KAPA Hyper Prep Kit
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活动期间下单或预存款,除享受超低价格和超全常规分析之外,可免费在以下10项高级分析中,任选 5 项加到最终报告模板中。
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详细分析内容请见文末
全方位的微生物服务体验,给您不一样的感觉
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基于丰富经验,给您专业、前沿、贴心的建议与指导和完善的售后服务
阅微基因提供1对1管家服务,安排专人与您直接对接,省去中间繁琐流程,并且每两周汇报项目进展。
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微生物业务部分知名合作伙伴
微生物代谢组联合分析服务,总价享受更大优惠
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肠道菌群和代谢组学的联合分析是目前研究中的前沿思路与技术,越来越多的研究者开始将微生物组学和代谢组学联合起来,从物种、基因以及代谢产物等水平共同解释科学问题。阅微基因提供微生物+代谢组联合分析完整解决方案,如订购此业务,总价可享受更大折扣,详情请咨询当地销售。
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阅微基因代谢组学检测服务项目
【高级分析内容】
1.【物种进化展示】GraPhlAn分析
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GraPhlAn分析可实现对物种进化树的可视化及注释,使进化树图的内容更丰富。不同分组可添加不同颜色的Biomarker。
2.【物种组成进化展示】Heat-tree分析
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热树(Heat-tree)图在16S微生物的分析中,可以弥补物种阶层累计柱状图的不足,使各个阶层的菌种组成更加能够一目了然,方便同时比对多组或多样本的差异。
3.【物种组成】Tree-map分析
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物种Tree-map(树形图)可更加直观的呈现不同分组间物种组成的差异,以及组内各物种的相对丰度比例。
4.【差异物种分析】Ternary Plot三元相图
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三元相图方便直观查看三组样本在不同分类阶层上优势菌种在各组别的含量差异。
5.【组间差异分析】MetagenomeSeq分析
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MetagenomeSeq将信息标准化后基于零膨胀高斯分布(Zero-inflated Gaussian distribution),利用组间物种丰度资料进行假设检验,从而筛选具有显著性的差异物种。
6.【关联分析】RDA/CCA环境因子分析
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典范对应分析(canonical correspondence analysis, CCA)或冗余分析(redundancy analysis, RDA)是基于对应分析发展而来的一种排序方法,将对应分析与多元回归分析相结合,每一步计算均与环境因子进行回归。CCA/RDA 分析可以检测环境因子、样品、菌群三者之间的关系或者两两之间的关系。(需提供关联因素数据)
7.【关联分析】物种Spearman关联分析
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通过绘制优势物种之间spearman相关性热图,可以发现优势物种之间重要的模式与关系,例如正相关或负相关,关联大小等。
8.【功能分析】差异功能分析
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通过LDA分析(线性回归分析)统计不同组别中有显著作用功能的LDA分值,展示了LDA 分值大于设定阈值的功能,即具有统计学差异的功能。柱状图的长度代表显著差异物种的影响大小。
9.【其他分析】ROC随机森林分析
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随机森林是一个包含多个决策树的集成学习方法,其输出的分类结果是由每棵决策树“投票”产生的结果。由于每棵树在构建过程中都采用了随机变量和随机抽样的方法,因此随机森林的分类结果具有较高的准确度。在微生物多样性的研究中随机森林常被用来筛选潜在的Biomarker。
10.【其他分析】OTU网络图分析
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通过对不同样本间的物种丰度信息进行相关性分析,得到物种在同一环境下的相互作用的情况,进一步解释样本间表型差异的形成机制,并从网络结构图中发现重要的模式或信息。
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